История:

21 декабря 1993 года Президент России Б.Н. Ельцин подписал указ об упразднении Министерства безопасности РФ и о создании Федеральной службы контрразведки Российской Федерации (ФСК России) . В состав ФСК вошли практически все подразделения упразднённого министерства безопасности, за исключением пограничных войск, выделенных в самостоятельную Федеральную пограничную службу Российской Федерации — главное командование Пограничных войск Российской Федерации (ФПС — главкомат).
5 января 1994 года были утверждены положение о службе и структура её центрального аппарата: директор, 5 заместителей (включая одного первого), коллегия из 11 человек, 18 управлений, секретариат и Центр общественных связей. В июле 1994 г. в составе центрального аппарата появилось управление шифровальной и специальной связи. В январе 1995 г. количество должностей заместителя директора было увеличено до шести .
3 апреля 1995 года был подписан Федеральный закон «Об органах федеральной службы безопасности в Российской Федерации», вступивший в силу 12 апреля 1995 года. В соответствии с ним ФСК была переименована в Федеральную службу безопасности Российской Федерации, при этом не проводилось организационно-штатных мероприятий, сотрудники службы (включая директора и его заместителей) оставались на своих должностях без переназначений и переаттестаций.

Структура центрального аппарата:

- Управление контрразведывательных операций
- Управление по контрразведывательному обеспечению стратегических объектов
- Управление военной контрразведки
- Управление экономической контрразведки
-Управление по борьбе с терроризмом
-Информационно-аналитическое управление
-Оперативно-поисковое управление
-Организационно-инспекторское управление
- Управление оперативно-технических мероприятий
-Управление научно-технического обеспечения
- Управление кадров
-Управление собственной безопасности
-Секретариат
- Договорно-правовое управление
-Управление регистрации и архивных фондов
-Управление шифровальной и специальной связи (с июля 1994 г.)
- Центр общественных связей
-Управление материально-технического обеспечения
- Финансово-экономическое управление
- Военно-медицинское управление
- Военно-строительное управление

Другие спецслужбы России в 1993—1995 гг.:

- Служба внешней разведки Российской Федерации (СВР)
- Федеральное агентство правительственной связи и информации при Президенте Российской Федерации (ФАПСИ)
- Федеральная пограничная служба Российской Федерации — главное командование Пограничных войск Российской Федерации ( ФПС — главкомат, с декабря 1994 г. — ФПС)
- Главное управление охраны Российской Федерации (с 1996 г. — ФСО)